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As principais portas de entrada para infecções nos pacientes neutropênicos são pele, trato respiratório superior e trato gastrointestinal.
A primeira medida após o diagnóstico de neutropenia febril é o início de esquema empírico de antibiótico.
A instituição de terapia empírica deve ser realizada com ceftriaxone ou ciprofloxacino.
A presença de mucosite predispõe à reativação de herpes simples e ela se manifesta na forma de úlceras na mucosa, como na primoinfecção.