Considerando os benefícios e os efeitos colaterais relacionados ao uso de terapia antirretroviral, as recomendações atuais para a grande maioria dos pacientes são de que seja iniciada:

Somente em pacientes com diagnóstico de SIDA.

Somente na presença de infecções repetidas, em qualquer sítio.

Somente quando a contagem de CD4 for menor ou igual a 350 céls/mcl.

Somente quando a contagem de CD4 for menor que 200 céls/mcl.

Quando a infecção pelo HIV for confirmada.