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A formação do sistema de Havers ocorre exclusivamente na ossificação endocondral e resulta da disposição aleatória dos osteócitos ao redor de canais vasculares.
As lamelas concêntricas são dispostas ao redor de canais centrais que contêm vasos e nervos, formando osteons funcionais organizados por osteócitos comunicantes por canalículos.
O sistema de Havers é composto por camadas paralelas de matriz óssea calcificada, sem a presença de vasos ou estruturas canaliculares.
Os osteócitos, após depositarem a matriz óssea, migram para os canais centrais onde se organizam em camadas radiais, formando o osso trabecular maduro.
O processo de formação do sistema de Havers está restrito aos ossos curtos e não ocorre nos ossos longos submetidos a estresse mecânico.