As principais fontes de microrganismos que podem contaminar os tecidos manipulados durante a cirurgia e favorecer o desenvolvimento da ISC (infecção do sítio cirúrgico) são endógenas, isto é, são provenientes do próprio paciente. Estes patógenos na maioria dos casos pertencem à própria microbiota do paciente. Menos frequentemente, estes microrganismos atingem o sítio operatório a partir de alguma infecção que o paciente esteja apresentando durante a cirurgia. Em relação ao potencial de contaminação da cirurgia e a estimativa da ISC, podemos classificar como cirurgia potencialmente contaminada a seguinte:

Feridas traumáticas recentes (com <4 horas) abertas, contaminação grosseira durante cirurgia de trato digestivo, manipulação de via biliar ou geniturinária na presença de bile ou urina infectadas, quebras maiores de técnica asséptica. Estimativa de ocorrência de ISC de 20%;

Feridas traumáticas antigas com tecido desvitalizado, corpos estranhos ou contaminação fecal, penetrante há mais de 4 horas, vísceras perfuradas ou secreção purulenta encontradas durante a cirurgia. Estimativa de ocorrência de ISC de 30 a 40%;

Cirurgias com múltiplas aderências devido cirurgias prévias, com rotura de colón, decorrente de abdome agudo obstrutivo. Estimativa de ocorrência de ISC > 50%.

Operações eletivas, feridas não infectadas, sítios cirúrgicos onde não é encontrada inflamação, não há abordagem de vísceras ocas (tratos respiratório, geniturinário, digestivo ou orofaringe), primariamente fechadas ou drenagem fechada, se necessária, não há quebra de técnica, trauma não penetrante. Estimativa de ocorrência de ISC <2%;

Há abordagem dos tratos digestivo, respiratório, geniturinário e orofaringe, situações controladas e sem contaminação não usual, cirurgia geniturinária: quando não há cultura de urina positiva, cirurgia biliar quando não há infecção de vias biliares, vagina e orofaringe quando não há evidência de infecção ou quebra de técnica. Estimativa de ocorrência de ISC <10%;