As proteínas eucarióticas de ativação gênica podem influenciar vários passos diferentes no início da transcrição. Em geral, onde diversos fatores atuam juntos na estimulação de uma taxa de reação, o efeito conjunto não é somente a soma das estimulações causadas por cada fator isolado , mas o seu produto.Portanto, as proteínas de ativação gênica, frequentemente, exibem o que é denominado de sinergia transcricional , em que a taxa de transcrição produzida por várias proteínas ativadoras atuando juntas é muito maior do que a produzida por qualquer dos ativadores atuando sozinho.